Тематический сетевой электронный научный журнал СКФНЦСВВ

Плодоводство
и виноградарство Юга России



Кожевников Евгений Анатольевич

-

Статьи в журнале (всего: 5)


pdf
696 Кб
12 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 16.05.2022
УДК: 634.84: 575.113.2
DOI: 10.30679/2219-5335-2022-3-75-85-96
Ключевые слова: ДИКОРАСТУЩИЕ ФОРМЫ ВИНОГРАДА, ДНК-МАРКЕРЫ, ПОЛИМОРФИЗМ

Реферат

На территории Краснодарского края виноград возделывается с древности. Однако изучение генофонда местного дикорастущего винограда остается открытым вопросом. Данная работа посвящена изучению дикорастущих лоз винограда, обнаруженных в районе Тонкого мыса города Геленджика. Эколого-географические и природно-климатические условия данной территории можно рассматривать как благоприятное место для произрастания дикого винограда. Было обнаружено 7 форм дикорастущего винограда, имеющих некоторые сходства и отличия о эколого-биологическим и морфологическим показателям. Большинство исследуемых форм двудомные растения – есть образцы как с мужским типом цветка, так и с женским. На одном экземпляре соцветия не были обнаружены. С найденных форм винограда был отобран материал для проведения ДНК-анализа. ДНК выделяли методом ЦТАБ из гербаризированных верхушек. Выполнено генотипирование дикорастущих форм по микросателлитным локусам VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD27, VrZag62, VrZag79, которые используются как стандартный набор для ДНК-паспортизации сортов винограда, а также по локусам UDV737 и CenGen6, которые сцеплены с генами устойчивости к милдью Rpv3 и оидиуму Ren9, соответственно. Целевые фрагменты, размер которых указывает на наличие генов устойчивости, по ДНК-маркерам UDV737 и CenGen6 не обнаружены. Полученные ДНК-профили по микросателлитным локусам показали генетические различия форм в анализируемой выборке. В среднем идентифицировано 5 типов аллелей на локус. Кластерный анализ данных ДНК-профилирования показал, что одна из найденных форм отличается от остальных наиболее значимо, остальные образцы по результатам анализа были распределены в два подкластера из двух и четырех генотипов.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Горбунов И. В., Котляр В. К., Кожевников Е. А. МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ДИКОРАСТУЩИХ ФОРМ ВИНОГРАДА НА ТЕРРИТОРИИ ТОНКОГО МЫСА ГОРОДА ГЕЛЕНДЖИК [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2022. № 75(3). С. 85–96. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/22/03/07.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2022-3-75-85-96 (дата обращения: 28.03.2024).
pdf
631 Кб
11 с.
Фитосанитарное состояние растений
Дата публикации: 20.01.2021
УДК: 634.8: 632.4: 575.174.015.3
DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-294-304
Ключевые слова: ВИНОГРАД, МИЛДЬЮ, PLASMOPARA VITICOLA, ГЕНЕРАЦИИ ПАТОГЕНА, ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ, ДНК-МАРКЕРЫ

Реферат

Милдью – заболевание виноградной лозы, вызываемое облигатным гетероталличным биотрофным эндопаразитом Plasmopara viticola. Ареалом распространения данного патогена являются виноградники всего мира, но наибольшие потери несут зоны виноградарства с умеренноконтинентальным и субтропическим климатом. В Краснодарском крае эпифитотийное развитее милдью бывает 6-7 раз за 10 лет. Первые молекулярногенетические исследования патогена были начаты ещё в конце ХХ века. Цель данной работы – оценить на основе ДНК-маркерного анализа полиморфизм популяции P. viticola в двух генерациях патогена на виноградных растениях, произрастающих в изолированной географической точке. Материалом для исследования послужили пораженные листья винограда, собранные на вегетационной площадке ФГБНУ СКФНЦСВВ с растений, не подвергавшихся химическим обработкам. Сбор материала осуществляли в двух временных интервалах – конец июля (первая генерация патогена – 4 образца) и середина августа (вторая генерация – 6 образцов). Для изучения разнообразия использовали высокополиморфные SSR-маркеры – GOB и PV144. ДНК P. viticola выделяли непосредственно из инфицированных листьев ЦТАБ-методом. Всего было проанализировано 10 образцов ДНК патогена. Исследование выполнено классическим методом полимеразной цепной реакции. Размер целевых фрагментов локусов PV144 и GOB оценивали при помощи автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 методом фрагментного анализа. Полученные данные анализировали в программе Gene Mapper 4.1. Наибольшая степень полиморфизма была обнаружена по маркеру GOB – 7 типов аллелей, в меньшей степени PV144 – 4 типа аллелей. Было установлено, что образцы популяция патогена, собранные в период первой генерации, обладают значительно большим генетическим полиморфизмом в отличие от образцов, собранных в период второй генерации. Исследования в данном направлении продолжаются.

Ссылка на статью
Кожевников Е. А., Макаркина М. В., Ильницкая Е. Т. ИЗУЧЕНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ПОПУЛЯЦИИ PLASMOPARA VITICOLA В РАЗНЫЕ ГЕНЕРАЦИИ ПАТОГЕНА [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2021. № 67(1). С. 294–304. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/21/01/20.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-294-304 (дата обращения: 28.03.2024).
pdf
404 Кб
13 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 20.11.2022
УДК: 634.8: 575.113.2
DOI: 10.30679/2219-5335-2022-6-78-195-207
Ключевые слова: ДИКОРАСТУЩИЕ ФОРМЫ ВИНОГРАДА, ОИДИУМ, REN1, ДНК-МАРКЕРЫ, ПОЛИМОРФИЗМ

Реферат

Исследование дикорастущих форм винограда позволяет расширить фундаментальные знания о разнообразии генофонда винограда, также дикие формы изучают с целью выявления потенциальных источников устойчивости к стресс-факторам условий произрастания. Ген устойчивости к оидиуму Ren1 – один из немногих генов устойчивости к патогенам, идентифицированных в Vitis vinifera. Также было обнаружено его присутствие в некоторых дикорастущих формах V. vinifera ssp. silvestris Gmel. Задачей данной работы было исследование дикорастущих форм винограда, найденных в Краснодарском крае, ДНК-маркерами гена устойчивости к оидиуму Ren1 с целью поиска потенциальных доноров резистентности. Исследование проводилось на 35 генотипах дикорастущего винограда, отобранных в нескольких географических точках Краснодарского края вдоль береговой линии Черного моря и реки Кубань. Полиморфизм локуса Ren1 изучали методом ПЦР с помощью косегрегирующих маркеров SC8-0071-014 и sc47-18 с последующей оценкой размера амплифицированных фрагметов методом капиллярного гель электрофореза на приборе Нанофор 05 и статистической обработкой в программе GenAlEx 6.5. В результате в изучаемой выборке генотипов выявлен достаточно высокий полиморфизм по исследуемым микросателлитным локусам (SC8-0071-014 – 18 типов аллелей, sc47-18 – 8 аллелей) – в среднем определено 13 аллелей на локус. В превалирующем большинстве генотипов определено гетерозиготное состояние по исследуемым локусам, что отражено показателями ожидаемой (He) и фактически выявленной (Ho) гетерозиготности: значения фактической превышают значения ожидаемой. Аллелей устойчивости гена Ren1 не обнаружено ни в одном из исследуемых образцов дикого винограда.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Кожевников Е. А., Панкин М. И. ПОЛИМОРФИЗМ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ, СЦЕПЛЕННЫХ С ГЕНОМ REN1, В ГЕНОТИПАХ ДИКОРАСТУЩИХ ФОРМ ВИНОГРАДА КУБАНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2022. № 78(6). С. 195–207. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/22/06/12.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2022-6-78-195-207 (дата обращения: 28.03.2024).
pdf
335 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 21.01.2022
УДК: 634.8.091: 575.113
DOI: 10.30679/2219-5335-2022-1-73-124-133
Ключевые слова: ВИНОГРАД, ДНК-МАРКЕРЫ, СЕЛЕКЦИЯ, УСТОЙЧИВОСТЬ К ОИДИУМУ

Реферат

Мучнистая роса винограда или оидиум – одно из наиболее распространенных и экономически значимых заболеваний винограда. Возбудителем заболевания является биотрофный аскомицет Erysiphe necator. Мучнистая роса является глобальным заболеванием, которое снижает урожайность и качество винограда, нанося при этом значительный ущерб виноградарству по всему миру. Большинство культивируемых сортов винограда восприимчивы к этому патогену, поэтому для снижения уровня заболеваемости, используют обработку пестицидами. Устойчивостью к оидиуму обладают, в основном, генотипы северо-американских и азиатских сортов винограда. Поиск доноров резистентности к оидиуму и последующее создание новых устойчивых и качественных сортов винограда, является одной из основных задач селекции винограда. Возделывание устойчивых сортов позволит сократить использование пестицидов, что в дальнейшем даст возможность перейти к более экологически безопасному промышленному виноградарству. В настоящее время идентифицирован ряд локусов устойчивости к оидиуму (более 10), также сконструированы ДНК-маркеры, пригодные для выявления аллельного состояния этих генов. Большой вклад среди идентифицированных локусов устойчивости к оидиуму имеют гены Ren3 и Ren9. В исследовании были задействованы элитные технические формы винограда селекции СКФНЦСВВ, генотипы которых потенциально могут содержать локусы устойчивости к оидиуму (Тана 19, Тана 72, Тана 73, Тана 74, Тана 82, Тана 92). Для идентификации генов, обуславливающих генетическую резистентность к оидиуму, были задействованы специфические кодоминантные SSR-маркеры GF15-42, ScORGF15-02, позволяющие идентифицировать ген Ren3, и SSR-маркер CenGen6 для идентификации гена Ren9. В качестве положительного контроля в работе использовали ДНК сорта Seyve Villard 12-375, который имеет аллели устойчивости. Работа проведена методом ПЦР, с разделением продуктов реакции при помощи метода капиллярного электрофореза на автоматическом генетическом анализаторе Нанофор 05. В результате ДНК-маркерного анализа определено, что генотип элитной формы Тана 92 содержит ген Ren9, гены Ren3 и Ren9 определены в формах Тана 73 и Тана 74.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Козина Т. Д., Кожевников Е. А., Пята Е. Г. ДНК-МАРКЕРНОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОВ УСТОЙЧИВОСТИ К ОИДИУМУ REN3 И REN9 В ЭЛИТНЫХ ФОРМАХ ВИНОГРАДА СЕЛЕКЦИИ СКФНЦСВВ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2022. № 73(1). С. 124–133. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/22/01/11.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2022-1-73-124-133 (дата обращения: 28.03.2024).
pdf
584 Кб
13 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 27.03.2023
УДК: 634.8: 575.113.2
DOI: 10.30679/2219-5335-2023-2-80-48-60
Ключевые слова: СОРТ ВИНОГРАДА, ГЕНОТИП, ДНК-МАРКЕРЫ, ДНК-ПАСПОРТ, УТОЧНЕНИЕ ПРОИСХОЖДЕНИЯ

Реферат

Использование ДНК-маркеров наряду с классическими методами идентификации, основанными на морфологической оценке, позволяет более точно определить сортовую принадлежность растений винограда, а также уточнить происхождение генотипов. Цель данной работы – выполнить генотипирование сортов винограда селекции Дагестанской селекционной опытной станции виноградарства и овощеводства (ДСОСВиО) при помощи микросателлитных маркеров (SSR), используемых для сортовой идентификации и уточнить происхождение сортов, пользуясь данными ДНК-анализа. Объектами исследования являлись шесть столовых сортов винограда – Везне, Дольчатый, Жемчужина Юга, Заря Дербента, Леки и Мускат дербенский. ДНК изучаемых сортов экстрагировали методом ЦТАБ из гербаризированного растительного материала. Генотипирование проводили при помощи стандартного набора SSR-маркеров: VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD27, VrZAG62, VrZAG79 методом ПЦР с последующим анализом результатов на генетическом анализаторе ABI Prism 3130, полученные данные обрабатывали при помощи программы GeneMapper v 4.1 и выравнивали относительно референсного сорта Пино нуар. Родословные сортов анализировали, основываясь на принципе кодоминантного наследования аллелей от родителей потомкам. ДНК-профили родительским форм (Жемчуг саба, Мускат александрийский, Мускат гамбургский, Кировабадский столовый) изучаемых сортов брали из международной базы данных сортов винограда VIVC (Vitis International Variety Catalogue), а также использовали разработанный нами ранее ДНК-паспорт сорта Агадаи. В результате исследования разработаны ДНК-паспорта 6 сортов селекции ДСОСВиО. По данным ДНК-анализа подтверждено происхождение сортов винограда Везне, Дольчатый, Жемчужина Юга, Заря Дербента, Леки и Мускат дербентский от заявленных родительских форм.

Ссылка на статью
Макаркина М. В., Ильницкая Е. Т., Козина Т. Д., Кожевников Е. А., Казахмедов Р. Э. ДНК-ПАСПОРТИЗАЦИЯ И АНАЛИЗ РОДОСЛОВНЫХ СОРТОВ ВИНОГРАДА СЕЛЕКЦИИ ДСОСВиО [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2023. № 80(2). С. 48–60. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/23/02/04.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2023-2-80-48-60 (дата обращения: 28.03.2024).